خلاصه دوره آموزشی بیوانفورماتیک مقدماتی
بیوانفورماتیک یک حوزه بین رشته ای است که روش ها و ابزارهای نرم افزاری را برای درک داده های بیولوژیکی ، به ویژه هنگامی که مجموعه داده ها بزرگ و پیچیده هستند، توسعه می دهد. به عنوان یک رشته بین رشته ای از علوم، بیوانفورماتیک زیست شناسی ، علوم کامپیوتر ، مهندسی اطلاعات ، ریاضیات و آمار را برای تجزیه و تحلیل و تفسیر داده های بیولوژیکی ترکیب می کند.
از بیوانفورماتیک در کجا می توان استفاده کرد؟
از بیوانفورماتیک برای تجزیه و تحلیل داده های بیولوژیکی با استفاده از تکنیک های ریاضی و آماری استفاده شده است.
بیوانفورماتیک به بخشی مهم در بسیاری از زمینه های زیست شناسی تبدیل شده است.
در زیست شناسی مولکولی، تکنیک های بیوانفورماتیک مانند پردازش تصویر و سیگنال امکان استخراج نتایج مفید از مقدار زیادی داده خام را فراهم می کند.
در زمینه ژنتیک ، به توالی و حاشیه نویسی ژنوم و جهش های مشاهده شده آن کمک می کند.
همچنین در تحلیل بیان و تنظیم ژن و پروتئین نقش دارد. ابزارهای بیوانفورماتیک در مقایسه ، تجزیه و تحلیل و تفسیر داده های ژنتیکی و ژنومی و به طور کلی در درک جنبه های تکاملی زیست شناسی مولکولی کمک می کنند.
در یک سطح یکپارچه تر ، به تحلیل و فهرست بندی مسیرهای بیولوژیکی و شبکه هایی که بخشی مهم از زیست شناسی سیستم ها هستند ، کمک می کند.
در زیست شناسی ساختاری ، به شبیه سازی و مدل سازی DNA ، RNA، پروتئین ها و همچنین فعل و انفعالات بیومولکولی کمک می کند.
برای مطالعه چگونگی تغییر فعالیت های سلولی طبیعی در حالت های مختلف بیماری ، داده های بیولوژیکی باید ترکیب شوند تا تصویری جامع از این فعالیت ها تشکیل شود. بنابراین ، حوزه بیوانفورماتیک به گونه ای تکامل یافته است که مهمترین وظیفه آن شامل تجزیه و تحلیل و تفسیر انواع مختلف داده است.
سرفصل های دوره آموزشی بیوانفورماتیک مقدماتی
فصل اول : آشنایی با بیوانفورماتیک و کاربردهای آن
فصل دوم: آشنایی با ( NCBIبانک های اطلاعاتی و نرم افزارها)
فصل سوم : نحوه جستجو در PubMed
فصل چهارم : بانک های اطلاعاتی اسیدهای نوکلئیک
فصل پنجم :BLAST
فصل ششم: بانک اطلاعاتی پروتئین
فصل هفتم : بانک های اطلاعاتی مربوط به بیماریها OMIM
بیوگرافی مدرس دوره آموزشی بیوانفورماتیک مقدماتی
با سلام وقت بخیر اینجانب مهدیه گنجی فارغ التحصیل کارشناسی ارشد زیست شناسی بیوفیزیک هستم.
یک مقاله ISI نوشته ام و ضریب ایمپکت 1.5 و معدل 18.60 دارم و توانستم با بهترین نمره از پایان نامه خود دفاع کنم
عنوان مقاله ISI:
Gold nanoparticles conjugated L- lysine for improving cisplatin delivery to human breast cancer cells
عنوان پایان نامه: ساخت نانو حامل داروی سیس پلاتین با استفاده از نانو ذرات طلا پوشش دار شده با ال – لایزین
دارای مدرک دوره بیوانفورماتیک و طراحی دارو پیشرفته از کمپانی سلمدکس فرانسه هستم.
سوالات رایج در مورد دوره آموزشی بیوانفورماتیک مقدماتی:
ازجمله سوالاتی که ممکن است ذهن مخاطب را درمورد علم بیوانفورماتیک مشغول نماید شامل موارد زیر است.
علم بیوانفورماتیک چیست و تاریخچه آن چیست این علم دارای چه زیرشاخه هایی است. موارد کاربرد این علم شامل چه موضاعاتی است.
ما دراین دوره آموزشی سعی میکنیم به صورت جامع و کامل به سوالات ذهنی شما پاسخ دهیم و با ابعاد مختلف این علم آشناشویم. لازم است دانشجویان و دانش پژوهان کشورعزیز ما نیز بیش از پیش با جنبه های مختلف این علوم نوین آشنا گردند.
تعریف علم بیوانفورماتیک چیست؟
بیوانفورماتیک علم نوینی است که در آن با استفاده از کامپیوتر، نرم افزارهای کامپیوتری و بانکهای اطلاعاتی سعی میگردد تا به مسائل بیولوژیکی بخصوص در زمینه های سلولی و ملکولی پاسخ داده شود.
در این علم با بکارگیری کامپیوتر سعی می گردد تا تحقیقات وسیعتری در خصوص پروتئینها و ژنها بعمل آید.
مواد اولیه آزمایشگاه بیوانفورماتیک عبارت است از اطلاعات خام بیولوژیک و تجهیزات مورد نیاز آن یک کامپیوتر با قدرت متوسط و یک اتصال اینترنت مناسب علاوه بر یک سری نرم افزار که عمدتاً بصورت رایگان قابل دست یابی می باشد.
تاریخچه علم بیوانفورماتیک
اصطلاح بیوانفورماتیک در ابتدا توسط پائولیئن هاگوگ و بن هسپر در سال ۱۹۷۰ برای توصیف «مطالعهی فرآیندهای اطلاعاتی در سیستمهای زیستی» ابداع شد و زمانی که اولین دادههای توالی بیولوژیکی به اشتراک گذاشته شدند، این اصطلاح هم رایج شد و اولین کاربردهایش را پیدا کرد. توسعه بیوانفورماتیک به عنوان یک رشته، نتیجهی پیشرفت در زیستشناسی مولکولی و علوم کامپیوتر در طول ۳۰ سال گذشته است.
زیرشاخه های بیوانفورماتیک چیست؟
دو شاخه اصلی بیوانفورماتیک، پروتئومیکس و ژنومیک میباشد.
ژنومیک:
ژنومیک شامل تجزیه و تحلیل دادها و اطلاعات ژنتیکی بخصوص ژنوم موجودات است. در حقیقت ژنوم را باید توالی کل DNA موجود در سلولهای یک جاندار دانست که بعنوان ماده ژنتیکی عمل می نماید و سبب بروز صفات وراثتی (فنوتیپ) میشود، با انتقال ماده وراثتی از یک نسل به نسل دیگر، صفات ارثی از یک نسل به نسل بعد منتقل میشود . بطور خلاصه باید گفت که ژنومیک شامل توالی یابی و آنالیز ژنها و رونوشتهای آنها در یک موجود زنده ست.
پروتئومیکس:
پروتئومیکس دانش بررسی ساختار و عملکرد پروتئینها در مقیاس بزرگ است. پروتئومیکس علم مطالعه گسترده پروتئوم شامل مطالعه بیان، تغییرات پس از ترجمه و مطالعه برهمکنش پروتئینها با سایر ملکولها است. پروتئومیکس یک شاخه نو پا در ژنومیکس کاربردی است که همزمان با اتمام پروژه توالی یابی ژنوم برخی موجودات مهم برای پاسخ گویی به سوالات پیش آمده در اثر توالی یابی ژنوم به وجود آمدهاست
آنالیز جامع پروتئینها با هدف بررسی تنوع ژنتیکی، مطالعه تفاوتها و مطالعه پاسخ به تنشها موضوع اصلی علم بین رشتهای پروتئومیکس است. پروتئومیکس با بهرهگیری از علوم شیمی پروتئینها، بیوانفورماتیک و زیستشناسی به شناسایی، کمیت سنجی، مطالعه تغییرات پس از ترجمه و برهمکنشهای پروتئینها میپردازد. هدف پروتئومیکس شناسایی پروتئینهای جدید بر اساس نقش، وظیفه و مطالعه نحوه بیان آنها در سیستمهای تنظیمی است.
علم بیوانفورماتیک برای چه رشته هایی مناسب تر است؟
این علم مفید برای دانشجویان و علم پژوهان رشته زیست شناسی ( کلیه گرایشات ) و بیو انفورماتیک و علوم کامپیوتر است.
کاربردهای اصلی بیوانفورماتیک چیست؟
کاربردهای اصلی آن شامل زمینههای زیر است:
پزشکی مولکولی
پزشکی شخصی شده
ژندرمانی
توسعه دارو
کاربردهای ژنومی میکروبی
پاکسازی مواد زائد
مطالعات تغییرات آب و هوایی
منابع انرژی جایگزین
تحقیقات حول محور سرطان
بهبود کیفیت تغذیه و…
